Plate-forme bio-informatique GenOuest (IRISA)

Introduction aux méthodes de phylogénie

stage court - formation qualifiante
 
PUBLIC
Chercheurs et ingénieurs, biologistes et bio-informaticiens souhaitant acquérir les concepts et méthologies nécessaires pour l’utilisation des outils de phylogénie moléculaire.

OBJECTIFS, COMPÉTENCES DÉVELOPPÉES

L’exploitation des outils de phylogénie moléculaire repose sur la bonne compréhension des concepts sous-jacents.

L’objectif de cette formation est de proposer une approche générale des outils d’étude et de reconstruction phylogénétique. À l’issue de cette formation, les stagiaires auront acquis une connaissance des divers outils et méthodes utilisables et seront en mesure de mieux interpréter les résultats fournis par ces mêmes outils.


PRÉ-REQUIS
Aucun.
 
ORGANISATION PÉDAGOGIQUE
Les formations sont dispensées sous forme de cours et travaux pratiques.

PROGRAMME

Session théorique :
- préambule historique et lexical ;
- la phylogénie moléculaire ;
- les méthodes d’analyse phylogénétiques :
   - méthodes de maximum de parcimonie,
   - les distances évolutives,
   - méthodes de distances,
   - méthodes de maximum de vraisemblance ;
- divers :
   - robustesse des arbres phylogénétiques,
   - attraction des longues branches

Session pratique :
- utilisation des outils d’analyse phylogénétique : phylowin, Mega, etc.



INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

Les programmes détaillés et des informations complémentaires sont consultables sur le site de la plate-forme bio-informatique GenOuest : http://www.genouest.org (rubrique formation).


INTERVENANT
E. CORRE
COORDINATION PÉDAGOGIQUE
Olivier COLLIN
ingénieur de recherche
CNRS / IRISA

 
CHARGÉ DE MISSION
Frédéric REMONTÉ

ASSISTANTE
Estelle RIO

PRIX :
nous consulter
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DURÉE :
2 jours
DATE(S) :
planning des sessions 2012
DÉPÔT DE DOSSIER :
Nombre de places minimum pour ouvrir la formation : 6
formulaire d'inscription
LIEU DE LA FORMATION :
institut de recherche en informatique et systèmes aléatoires (IRISA)
campus de Beaulieu - 35000 Rennes
CONTACT :
Estelle RIO
tél. : +33 (0)2 23 23 39 50
sfc-irisa@univ-rennes1.fr
service formation continue
4, rue kléber - 35000 Rennes

Service formation continue - université de Rennes 1
4 rue Kléber 35000 Rennes - tél. : +33 (0)2 23 23 39 50 - fax : +33 (0)2 99 63 30 33 - courriel : sfc@univ-rennes1.fr
dernière mise à jour : Mercredi 8 Février, 2012 14:37
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