Introduction à Cytoscape

Cytoscape est un logiciel permettant de visualiser les réseaux d’interactions moléculaires et les voies métaboliques, avec leurs annotations, leurs profils d’expression ou d’autres attributs associés.

L’objectif de cette formation est de proposer une première expérience pratique du logiciel. À l’issue de cette formation, les stagiaires possèderont les bases suffisantes pour une utilisation autonome de cet outil.

Présentation de Cytoscape et des sources de données d’interaction. 

Construction d’un premier réseau d’interaction :
- mise en place de cytoscape ;
- importation d’un réseau ;
- manipulations.

Les plugins de Cytoscape :
- installation d’un plugin ;
- présentation de quelques plugins.

Les programmes détaillés et des informations complémentaires sont consultables sur le site de la plate-forme bio-informatique GenOuest : http://www.genouest.org (rubrique formation).

• Téléchargez la plaquette de présentation de l'ensemble des stages courts en bio-informatique.