Plate-forme bio-informatique GenOuest (IRISA)

Perl avancé : Perl Objet et BioPerl

stage court - formation qualifiante
 
PUBLIC
Chercheurs et ingénieurs, biologistes et bio-informaticiens souhaitant maîtriser un langage de programmation pour automatiser l’analyse de leurs données et developer des applications spécifiques.

OBJECTIFS, COMPÉTENCES DÉVELOPPÉES
Maîtriser les notions avancées de PERL pour le développement d’applications en bioinformatique.

PRÉ-REQUIS
Connaissance de Perl ou avoir assister au module “introduction à Perl”. Connaissances de l’environnement UNIX
 
ORGANISATION PÉDAGOGIQUE
Les formations sont dispensées sous forme de cours et travaux pratiques. Les exemples seront pris sur une analyse de données de génomique - transcriptomique.

PROGRAMME

- Rappels de quelques notions indispensables: référence, hachage, modules.
- Notions de programmation orientée objet.
- PERL objet.
- BioPERL.
- Générer et utiliser un modèle objet à partir une bases de données avec Class::DBI.
- Manipuler des données NGS avec samtools et Bio::DB::Sam.



INFORMATIONS COMPLÉMENTAIRES

Les programmes détaillés et des informations complémentaires sont consultables sur le site de la plate-forme bio-informatique GenOuest : http://www.genouest.org (rubrique formation).


INTERVENANT
F. LEGEAI
COORDINATION PÉDAGOGIQUE
Olivier COLLIN
ingénieur de recherche
CNRS / IRISA


 
CHARGÉ DE MISSION
Frédéric REMONTÉ

ASSISTANTE
Estelle RIO

PRIX :
nous consulter
en savoir plus sur les modalités de financement de votre formation
DURÉE :
3 jours
DATE(S) :
planning des sessions 2012
DÉPÔT DE DOSSIER :
Nombre de places minimum pour ouvrir la formation : 6
formulaire d'inscription
LIEU DE LA FORMATION :
institut de recherche en informatique et systèmes aléatoires (IRISA)
campus de Beaulieu - 35000 Rennes
CONTACT :
Estelle RIO
tél. : +33 (0)2 23 23 39 50
sfc-irisa@univ-rennes1.fr
service formation continue
4, rue kléber - 35000 Rennes

Service formation continue - université de Rennes 1
4 rue Kléber 35000 Rennes - tél. : +33 (0)2 23 23 39 50 - fax : +33 (0)2 99 63 30 33 - courriel : sfc@univ-rennes1.fr
dernière mise à jour : Mercredi 8 Février, 2012 14:37
Retour accueil
Validez vos acquis (VAE)
puce Financez votre formation
puce Domaines de formation :
  fleche gestion
  fleche économie
  fleche droit
  fleche santé
  fleche informatique
  fleche technologies
  fleche environnement
  fleche agroalimentaire
  fleche génie civil
  fleche communication
       journalisme
  fleche carrières sociales
  fleche autres domaines
puce Types de formation :
  fleche masters
  fleche licences professionnelles
  fleche stages courts
  fleche formations en alternance
  fleche formations à distance
 
Loading